192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0071 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0071  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 95 aa  187  4e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0041  30S ribosomal protein S20  94.74 
 
 		 95 aa  181  3e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.418613  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  59.3 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0792  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0390  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  40.23 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  39.13 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  39.13 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4102  SSU ribosomal protein S20P  40.23 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5079  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0001  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000869567 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  41.77 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  41.38 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3031  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.362644  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4886  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4421  30S ribosomal protein S20  34.94 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  43.01 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5323  30S ribosomal protein S20  37.97 
 
 		 88 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.761405  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1341  30S ribosomal protein S20  37.23 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0010  30S ribosomal protein S20  37.23 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3143  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4712  30S ribosomal protein S20  36.14 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4943  30S ribosomal protein S20  36.25 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0001  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00020529  normal  0.124488 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3188  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0921444 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0001  30S ribosomal protein S20  33.7 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000133909  decreased coverage  0.0000000319383 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4039  30S ribosomal protein S20  37.97 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  40 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4212  30S ribosomal protein S20  34.48 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7874  30S ribosomal protein S20  35.44 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  39.76 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  40 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 87 aa  50.4  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 87 aa  50.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3338  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3274  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1690  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000410806  hitchhiker  0.0000000528048 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004422  SSU ribosomal protein S20p  40.7 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000816133  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  41.89 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  36.71 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  36.71 
 
 		 88 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2556  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  34.52 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  35.71 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>