More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3546 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 89 aa  174  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  51.76 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  51.76 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  52.94 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4212  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2678  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.855392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2556  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  51.76 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  51.76 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3031  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.362644  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  45.88 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3210  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  41.18 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  50.59 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  42.86 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0531  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  42.5 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2024  ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000205272  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1471  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  40.48 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0478  SSU ribosomal protein S20P  42.35 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.075192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3181  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0928109  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2904  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1080  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000335633  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1756  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.443874  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3203  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5883  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 90 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>