291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1134 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 96 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  98.96 
 
 		 96 aa  184  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  63.64 
 
 		 95 aa  103  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  55.68 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  56.47 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  46.07 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  43.3 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  42.57 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  45.56 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  41.58 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  42.55 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  42.57 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1384  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1265  ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.15154e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  40.62 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  48.72 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  46.25 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  51.28 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  47.5 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 86 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  42.22 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  39.36 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  44.83 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  38.3 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  42.22 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0389  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.17035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  43.53 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  44.19 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  36 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  40.22 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  39.6 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  38.78 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  38.78 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  38.3 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  38.78 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  38.38 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  38.38 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  37.78 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  38.78 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>