244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1265 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1265  ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  168  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.15154e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  42.53 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1648  ribosomal protein S20  44.16 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2556  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  39.29 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  38.37 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  40.48 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0238  30S ribosomal protein S20  48 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00017388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  40.7 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0492  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131868  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0100  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0478  SSU ribosomal protein S20P  38.37 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.075192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  41.56 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  39.24 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000542728  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000161385  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  35.71 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000398649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2181  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752642  normal  0.564535 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3274  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  41.98 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  41.86 
 
 		 86 aa  50.8  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2904  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  50.8  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>