231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1648 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1648  ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  160  7e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  50 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1265  ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.15154e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0646  ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 88 aa  60.1  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  49.38 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  46.58 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  44.87 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  45.78 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  48.05 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  42.31 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4938  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000396831  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  44.87 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  44.87 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  41.03 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  42.31 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  46.99 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  46.99 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  46.99 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 86 aa  52.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01050  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0492  ribosomal protein S20  42.31 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131868  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  45.71 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  42.31 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0100  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  41.38 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000542728  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000161385  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  42.31 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000398649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  37.35 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>