220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0646 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0646  ribosomal protein S20  100 
 
 		 86 aa  162  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  44.58 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1648  ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  43.37 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  41.77 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  43.24 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  39.51 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2024  ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000205272  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  41.89 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1517  SSU ribosomal protein S20P  36.76 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.256049  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  32.53 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_002620  TC0907  30S ribosomal protein S20  47.46 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  43.24 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  39.51 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  37.84 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  41.46 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  41.46 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  36.14 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  40.26 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  34.18 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  40.26 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  40.26 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  36.14 
 
 		 88 aa  47.4  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  39.19 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  41.56 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  34.94 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  36.14 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 86 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  32.94 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4102  SSU ribosomal protein S20P  40.96 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  37.84 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  36.25 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  36.25 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  36.25 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  33.75 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  39.19 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  39.19 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  32.53 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0390  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>