284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1639 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 88 aa  169  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  100 
 
 		 88 aa  169  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  94.32 
 
 		 88 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  51.22 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  40.23 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  42.22 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  51.25 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  40 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  44.16 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  40.51 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  40 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  39.36 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  38.82 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  39.36 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  52.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2024  ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000205272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  40.51 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  42.39 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  45.31 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  38.95 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  36.47 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0478  SSU ribosomal protein S20P  38.55 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.075192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  36.14 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  36.9 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0421  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.297781  normal  0.0196002 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  36.9 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0388  30S ribosomal protein S20  41.57 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000012628  normal  0.0229043 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0320  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0389  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.17035  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3191  ribosomal protein S20  51.61 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00000247507  normal  0.0669339 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1471  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5203  30S ribosomal protein S20  42.22 
 
 		 91 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.614694  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  36.14 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1265  ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.15154e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>