177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0320 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0320  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 91 aa  178  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0424  30S ribosomal protein S20  83.52 
 
 		 91 aa  150  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0389  30S ribosomal protein S20  81.32 
 
 		 91 aa  149  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.17035  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0456  30S ribosomal protein S20  85.06 
 
 		 93 aa  148  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1759  30S ribosomal protein S20  89.01 
 
 		 91 aa  140  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000334596  normal  0.310649 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0421  30S ribosomal protein S20  83.52 
 
 		 91 aa  136  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.297781  normal  0.0196002 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0388  30S ribosomal protein S20  83.15 
 
 		 91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000012628  normal  0.0229043 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 91 aa  52.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  41.33 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  37.04 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  41.33 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  34.09 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  40 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  44.16 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  38.67 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  41.89 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292559  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  37.36 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  36.67 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  38.96 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  38.96 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  34.09 
 
 		 87 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  34.09 
 
 		 87 aa  47.4  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5883  30S ribosomal protein S20  33.78 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  33.78 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  34.67 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1384  ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  40.66 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4938  30S ribosomal protein S20  37.8 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0524  ribosomal protein S20  35.16 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000452156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  35.63 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  39.19 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  32.94 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  34.67 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01050  30S ribosomal protein S20  39.02 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  35.23 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  37.35 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2678  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.855392  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  35.16 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0238  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 85 aa  43.9  0.0009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00017388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1723  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  34.67 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5203  30S ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.614694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>