163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0421 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0421  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.297781  normal  0.0196002 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0320  30S ribosomal protein S20  83.52 
 
 		 91 aa  152  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0389  30S ribosomal protein S20  80.22 
 
 		 91 aa  149  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.17035  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0424  30S ribosomal protein S20  78.02 
 
 		 91 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0388  30S ribosomal protein S20  93.1 
 
 		 91 aa  140  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000012628  normal  0.0229043 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0456  30S ribosomal protein S20  75.56 
 
 		 93 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1759  30S ribosomal protein S20  75.82 
 
 		 91 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000334596  normal  0.310649 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  40.54 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  37.33 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1384  ribosomal protein S20  35.23 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  35.8 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  36.67 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  41.56 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  41.56 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  38.27 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 89 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  36.84 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  36.67 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  35.16 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  39.02 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6841  ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3203  30S ribosomal protein S20  32.05 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1648  ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2678  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.855392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  35.29 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0759  30S ribosomal protein S20  32.05 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  35.37 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  36.59 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  35.56 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1723  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1153  30S ribosomal protein S20  36.25 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.320164  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  37.35 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  34.12 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  35.56 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  32.05 
 
 		 88 aa  43.9  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0238  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00017388  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2556  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  34.48 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  34.83 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  36.25 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3027  30S ribosomal protein S20  36.84 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>