191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0389 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0389  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.17035  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0424  30S ribosomal protein S20  81.32 
 
 		 91 aa  150  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0320  30S ribosomal protein S20  81.32 
 
 		 91 aa  149  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0456  30S ribosomal protein S20  77.53 
 
 		 93 aa  138  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0421  30S ribosomal protein S20  80.22 
 
 		 91 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.297781  normal  0.0196002 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0388  30S ribosomal protein S20  81.32 
 
 		 91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000012628  normal  0.0229043 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1759  30S ribosomal protein S20  74.73 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000334596  normal  0.310649 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  41.33 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 86 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  36.25 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  36.25 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  43.24 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  38.27 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  40.26 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  37.18 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  34.83 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  35.96 
 
 		 94 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  35.71 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  38.67 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  32.95 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  37.8 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  36.84 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 89 aa  47.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  34.57 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  34.57 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  47.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  34.57 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0524  ribosomal protein S20  34.12 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000452156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  35.96 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  39.13 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  37.35 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  34.57 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  35.8 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  33.33 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  34.57 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  37.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292559  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  34.57 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  34.57 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  34.07 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0238  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00017388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>