258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1018 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 98 aa  197  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 98 aa  197  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  68.42 
 
 		 98 aa  138  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  66.33 
 
 		 100 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  68.42 
 
 		 98 aa  136  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  61.86 
 
 		 100 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  61.7 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  59.57 
 
 		 97 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  59.34 
 
 		 116 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  58.51 
 
 		 97 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  58.14 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  54.44 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  54.84 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  53.76 
 
 		 97 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  51.06 
 
 		 99 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  53.76 
 
 		 97 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  53.76 
 
 		 97 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  53.19 
 
 		 97 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  45.05 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  44.21 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  44.68 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  44.68 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  44.68 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  41.76 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  45.16 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  38.3 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  46.32 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  42.11 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  40.62 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  42.11 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  44.68 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  37.36 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  42.22 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  46.99 
 
 		 86 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  40.66 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  40.66 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  40.66 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  40.23 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  40.66 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  37.63 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  40.23 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  39.13 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  35.56 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  35.16 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0577  30S ribosomal protein S20  37.36 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000729927  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  35.48 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_9610  predicted protein  38.75 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  39.13 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  35.16 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  35.48 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  35.48 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  41.76 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  35.48 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 93 aa  52.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  35.48 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  35.48 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  37.36 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  42.05 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  38.46 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 86 aa  52  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>