288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1587 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 88 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  44.83 
 
 		 88 aa  72  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  46.32 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  43.33 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  53.09 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  44.94 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  42.5 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  38.3 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  38.3 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  42.47 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  38.37 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5203  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.614694  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3191  ribosomal protein S20  50 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00000247507  normal  0.0669339 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  42.86 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  41.27 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3188  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0921444 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3210  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0010  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1341  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  38.27 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  39.73 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  38.37 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3009  30S ribosomal protein S20  41.79 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  39.36 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  34.48 
 
 		 87 aa  52.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>