188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3191 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3191  ribosomal protein S20  100 
 
 		 68 aa  132  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00000247507  normal  0.0669339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  92.73 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  68.42 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  49.18 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  50.79 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2181  30S ribosomal protein S20  50.85 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752642  normal  0.564535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3009  30S ribosomal protein S20  43.06 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  45.16 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  49.12 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1454  30S ribosomal protein S20  47.46 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2427  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3000  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  50.88 
 
 		 100 aa  50.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  45.9 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  53.23 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0290  ribosomal protein S20  44.12 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000431613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  47.46 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  51.61 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  52.46 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  52.46 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  51.61 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  46.27 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2122  30S ribosomal protein S20  45.76 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00639471  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3570  30S ribosomal protein S20  45.76 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  49.12 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  45.9 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  46.67 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  47.54 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  46.27 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  52.83 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  43.28 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  47.46 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  49.18 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  50.85 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  49.15 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  46.97 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2678  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.855392  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  47.76 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1167  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  48.44 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  47.46 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  47.46 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  50.85 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  51.85 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  47.46 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  48.33 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  47.46 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  43.94 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  43.28 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  48.21 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  49.09 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2904  30S ribosomal protein S20  44.64 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4102  SSU ribosomal protein S20P  43.28 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  43.28 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  44.07 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  50.88 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  40.3 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.07 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  46.03 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  43.28 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  44.07 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000396831  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  49.18 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  40.98 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  40.98 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  50.85 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  42.37 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  44.64 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  40.68 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  47.46 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  45.76 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  47.54 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1777  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0001  30S ribosomal protein S20  40.68 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000133909  decreased coverage  0.0000000319383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  49.15 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  42.19 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  50 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  47.46 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1583  30S ribosomal protein S20  49.09 
 
 		 83 aa  43.5  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.74402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>