More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0126 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 95 aa  183  8e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  64.77 
 
 		 96 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  57.14 
 
 		 91 aa  105  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  63.64 
 
 		 96 aa  103  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1384  ribosomal protein S20  49.44 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  47.83 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  46.99 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  38.3 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  38.3 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1454  30S ribosomal protein S20  46.88 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1432  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.195476 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  45.05 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0947  ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.351712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  42.22 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0847  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  38.3 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  37.36 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  44.71 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  41.76 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  39.36 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0492  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131868  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0071  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  37.76 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  35.42 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  35.11 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  35.05 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  47.44 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  37.78 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  43.01 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3009  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  45.68 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  44.94 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0041  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.418613  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  36.26 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  35.42 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  35.42 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2122  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00639471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  43.01 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  41.76 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  42.31 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>