294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0850 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 78 aa  147  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  85.71 
 
 		 77 aa  130  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  75.32 
 
 		 77 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  59.04 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  55.42 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  56.63 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  56.63 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  50.6 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  50.6 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1583  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.74402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  53.01 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  50.6 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  51.25 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  51.25 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  51.25 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  51.25 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  51.25 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  51.25 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  51.25 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  51.25 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  49.41 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 84 aa  62  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  50.6 
 
 		 87 aa  62  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  50.6 
 
 		 87 aa  62  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  50.6 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  50.6 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  50.6 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  46.43 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1172  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000575412  hitchhiker  0.00000000402538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  42.22 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00014  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123306  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  43.53 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  49.35 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  46.05 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  46.99 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  49.35 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  48.19 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  42.17 
 
 		 86 aa  57  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  45 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  46.99 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1122  30S ribosomal protein S20  51.9 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.453734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  44.16 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  44.71 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1756  30S ribosomal protein S20  50.6 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.443874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  46.25 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1284  SSU ribosomal protein S20P  44.87 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2556  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>