216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0647 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 84 aa  162  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292559  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1583  30S ribosomal protein S20  65.48 
 
 		 83 aa  104  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.74402  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1284  SSU ribosomal protein S20P  55.13 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1172  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000575412  hitchhiker  0.00000000402538 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  54.32 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1153  30S ribosomal protein S20  51.28 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.320164  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1678  30S ribosomal protein S20  52.56 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1643  30S ribosomal protein S20  52.56 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 77 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 78 aa  62  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  43.59 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  46.43 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3009  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  47.5 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2181  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752642  normal  0.564535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3570  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1454  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368.1  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.5112799999999996e-45  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  44.87 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  43.59 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  44.87 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  44.16 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  45 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  45.21 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  47.3 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  42.35 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2427  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3000  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  41.46 
 
 		 89 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  47.56 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  47.22 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000396831  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  47.56 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  47.56 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3210  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  41.86 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2122  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00639471  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  47.73 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0424  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0320  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1167  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  40 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  47.44 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2678  30S ribosomal protein S20  45.95 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.855392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  44.87 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  40 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  47.95 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  46.15 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  44.87 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  44.87 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  44.87 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000161385  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000542728  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0456  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000398649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  48.53 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>