151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0456 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0456  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 93 aa  186  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0320  30S ribosomal protein S20  85.06 
 
 		 91 aa  148  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0424  30S ribosomal protein S20  81.11 
 
 		 91 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0389  30S ribosomal protein S20  77.53 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.17035  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1759  30S ribosomal protein S20  83.33 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000334596  normal  0.310649 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0421  30S ribosomal protein S20  75.56 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.297781  normal  0.0196002 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0388  30S ribosomal protein S20  76.4 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000012628  normal  0.0229043 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6841  ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  39.77 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  36.96 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  38.16 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  35.44 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1723  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292559  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  41.56 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0238  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00017388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  35.87 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  37.78 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4938  30S ribosomal protein S20  37.8 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  37.33 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1384  ribosomal protein S20  35.23 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  37.33 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  33.72 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  37.33 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  32.58 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  34.83 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  35.96 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1265  ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.15154e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  34.04 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  36 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  39.19 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  36.84 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  36.67 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  32 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  32 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  32 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  32 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  32 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0531  30S ribosomal protein S20  36 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0856  ribosomal protein S20  32.95 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.819382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  36.25 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  32.56 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  35.53 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  35.53 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  35.63 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  37.33 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  34.21 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  32.56 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  34.57 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  32.56 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  32.56 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0100  30S ribosomal protein S20  30.59 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  35.23 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  35.37 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  35.37 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>