223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1678 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1678  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 83 aa  156  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1643  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 83 aa  156  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1153  30S ribosomal protein S20  75.9 
 
 		 83 aa  124  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.320164  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  52.56 
 
 		 84 aa  70.1  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  54.43 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  55.7 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  51.85 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 77 aa  60.1  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1172  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000575412  hitchhiker  0.00000000402538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  40.24 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1583  30S ribosomal protein S20  46.15 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.74402  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  43.04 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368.1  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.5112799999999996e-45  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  40.66 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  47.44 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  46.43 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 86 aa  52  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01050  30S ribosomal protein S20  41.03 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  42.5 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  43.06 
 
 		 86 aa  50.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  45.57 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 162 aa  50.4  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 87 aa  50.4  0.000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 86 aa  50.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  42.31 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  43.06 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  37.18 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1284  SSU ribosomal protein S20P  43.04 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  41.56 
 
 		 87 aa  49.7  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  41.03 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 86 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  41.77 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  43.06 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  36 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  45.83 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  39.19 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 88 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 88 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>