171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1583 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1583  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 83 aa  166  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.74402  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  65.48 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292559  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1284  SSU ribosomal protein S20P  63.86 
 
 		 88 aa  103  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  54.43 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1172  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000575412  hitchhiker  0.00000000402538 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  55.7 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  46.99 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  47.56 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  47.56 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2181  30S ribosomal protein S20  46.99 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752642  normal  0.564535 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1153  30S ribosomal protein S20  43.59 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.320164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3570  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1643  30S ribosomal protein S20  46.15 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1678  30S ribosomal protein S20  46.15 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1454  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3009  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  46.15 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  41.46 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  40.26 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2122  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00639471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  41.67 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 90 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  39.76 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2427  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  41.18 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  45.33 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3000  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 109 aa  50.8  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  44.74 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  44.74 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  44.74 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  44.74 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  44.74 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1167  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  44.74 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  37.36 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5883  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  35.9 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1777  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0531  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  36.25 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3210  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3203  30S ribosomal protein S20  40.79 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 87 aa  47.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3027  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>