263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0950 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 77 aa  150  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  85.71 
 
 		 78 aa  130  6.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  84.42 
 
 		 77 aa  124  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  57.83 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1583  30S ribosomal protein S20  54.43 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.74402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  51.81 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  51.81 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  51.81 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  46.99 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  47.44 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  45 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1172  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000575412  hitchhiker  0.00000000402538 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1678  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1643  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  42.17 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1153  30S ribosomal protein S20  44.87 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.320164  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  41.67 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  47.95 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  46.99 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  42.5 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1284  SSU ribosomal protein S20P  46.15 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00014  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>