218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0819 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 84 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  71.08 
 
 		 87 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  72.29 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  62.65 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0524  ribosomal protein S20  61.9 
 
 		 88 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000452156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0100  30S ribosomal protein S20  59.04 
 
 		 83 aa  96.7  9e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4938  30S ribosomal protein S20  62.65 
 
 		 83 aa  95.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01050  30S ribosomal protein S20  62.65 
 
 		 82 aa  93.6  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  56.63 
 
 		 84 aa  90.1  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1723  30S ribosomal protein S20  56.63 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6841  ribosomal protein S20  53.01 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  67  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  45.35 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  40.7 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000396831  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  48.05 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  42.86 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  40.96 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  36.05 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  38.37 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  40.7 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 90 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  39.08 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2301  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  41.86 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  39.53 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  39.08 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  36.9 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  36.67 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000398649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000161385  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000542728  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  47.4  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  38.71 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>