244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0747 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0747  Hly-III family protein  100 
 
 
220 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3228  channel protein, hemolysin III family  62.69 
 
 
206 aa  222  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  47.8 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  45.1 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  44 
 
 
205 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  44 
 
 
205 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  44.17 
 
 
206 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  43.5 
 
 
205 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  44 
 
 
205 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  43.5 
 
 
205 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  43 
 
 
204 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  42.72 
 
 
206 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  44.23 
 
 
214 aa  155  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  44.28 
 
 
205 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  43 
 
 
204 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  44 
 
 
205 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  42.29 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  41.75 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  44 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  41.75 
 
 
206 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  41.75 
 
 
206 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  41.75 
 
 
206 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  41.95 
 
 
205 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  41.75 
 
 
206 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  41.75 
 
 
206 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  41.75 
 
 
206 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  41.75 
 
 
206 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  41.26 
 
 
206 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  40.78 
 
 
206 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  40.78 
 
 
206 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  41.26 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  41.26 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  41.26 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  39.15 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2738  channel protein, hemolysin III family  44.12 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  41.26 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  41.26 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  42.93 
 
 
205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  40.1 
 
 
208 aa  145  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5210  HylII  43.9 
 
 
205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611368  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  38.5 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4053  channel protein, hemolysin III family  39.05 
 
 
220 aa  137  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.324319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  39.39 
 
 
214 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  44.02 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  40.29 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  44.02 
 
 
214 aa  135  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  40.3 
 
 
221 aa  134  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  40.2 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  37.44 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  36.45 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0157  HylII  39.23 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  35.47 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  37.56 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  39.6 
 
 
217 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3552  hemolysin III family channel protein  42.29 
 
 
214 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  36.15 
 
 
215 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  40.29 
 
 
215 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  37.81 
 
 
226 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3992  channel protein, hemolysin III family  38.89 
 
 
214 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000238096 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  37.88 
 
 
224 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  39.49 
 
 
220 aa  121  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  38.24 
 
 
218 aa  121  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  37.25 
 
 
218 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  36.68 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  36.87 
 
 
227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  35.82 
 
 
219 aa  118  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  36.24 
 
 
227 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  37.62 
 
 
233 aa  117  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  37.37 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  39.47 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  40.1 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  37.37 
 
 
227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  36.71 
 
 
227 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  36.18 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  36.18 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  36.18 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  36.18 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  36.18 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1873  channel protein, hemolysin III family protein  38.92 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  36.18 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  36.18 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  41.21 
 
 
241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  36.18 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  36.18 
 
 
219 aa  115  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  32.7 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0873  hemolysin III family channel protein  35.86 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  36.18 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  37.19 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3838  hemolysin III family protein  35.86 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.69609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  36.18 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  36.18 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  36.18 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  36.18 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0870  hemolysin III family protein  35.86 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  31.63 
 
 
219 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  36.18 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1550  channel protein, hemolysin III family  34.67 
 
 
211 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  36.14 
 
 
218 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  34.72 
 
 
218 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  36.32 
 
 
215 aa  111  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>