248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3228 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3228  channel protein, hemolysin III family  100 
 
 		 206 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0747  Hly-III family protein  62.69 
 
 		 220 aa  241  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  50.24 
 
 		 205 aa  187  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  50.75 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  47.57 
 
 		 205 aa  184  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  50 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  50 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  50 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  50 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  50 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  50 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  49.51 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  50.75 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  48.54 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  48.54 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  45.63 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  48.54 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  49.03 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  48.06 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  49.03 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2738  channel protein, hemolysin III family  51.24 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  48.54 
 
 		 205 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  48.06 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  48.06 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  48.06 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  49.75 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  47.57 
 
 		 205 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  47.57 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5210  HylII  52.74 
 
 		 205 aa  175  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  43.69 
 
 		 205 aa  174  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  45.15 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  45.37 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  44.88 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  45.37 
 
 		 205 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  44.55 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  44.66 
 
 		 204 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  45.37 
 
 		 205 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  46.5 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  43.63 
 
 		 208 aa  161  8.000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  46.8 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  48.48 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4053  channel protein, hemolysin III family  44.83 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.324319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  43.69 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  39.42 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  44.33 
 
 		 221 aa  151  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0157  HylII  45.63 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  45.1 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  46.73 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  43.9 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  46.73 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  42.35 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  44.33 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3992  channel protein, hemolysin III family  43.9 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000238096 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  42.79 
 
 		 224 aa  141  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  42 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  41.38 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  40.78 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  39.7 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  41.18 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  41.18 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  41.18 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  41.18 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  41.18 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  41.18 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  41.18 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  41.18 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  40.69 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  39.9 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  39.9 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  41.18 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  39.51 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  46.27 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  40.2 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  38.61 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  39.8 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  38.5 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  40.39 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  40.39 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  36.95 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  40.39 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  40.39 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  40.39 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  37.56 
 
 		 215 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  43.43 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  37.75 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  36.14 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  45.45 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  39.8 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3552  hemolysin III family channel protein  43.56 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  37.09 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  37.09 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  37.37 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  37.09 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  38.61 
 
 		 216 aa  124  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1993  channel protein, hemolysin III family  48.08 
 
 		 225 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0837698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2360  channel protein, hemolysin III family  48.08 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  38.42 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  38.42 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  38.42 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  38.42 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>