249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1993 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1993  channel protein, hemolysin III family  100 
 
 		 225 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0837698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2360  channel protein, hemolysin III family  100 
 
 		 217 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  47.6 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  46.86 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  44.06 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  43.56 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  45.54 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  43.75 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  43.35 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  42.86 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  42.86 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  44.06 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  43.35 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  42.86 
 
 		 206 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  42.86 
 
 		 206 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  42.11 
 
 		 216 aa  155  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  42.86 
 
 		 206 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  43.5 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3552  hemolysin III family channel protein  44.71 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0531  hemolysin III  43.75 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.666008 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  42.36 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  42.36 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  41.5 
 
 		 220 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  38.24 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  42.36 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  42.36 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  42.36 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  42.36 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  41.38 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  41.23 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2738  channel protein, hemolysin III family  45.05 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  36.92 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3992  channel protein, hemolysin III family  44.34 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000238096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  44.06 
 
 		 205 aa  147  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  38.73 
 
 		 216 aa  147  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03143  putative hemolysin III  40 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  37.74 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  42.21 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  37.16 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  38.21 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  38.21 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  37.85 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  38.21 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  38.21 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  38.21 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  38.21 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  38.21 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  41.55 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  38.21 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  39.32 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  42.71 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  43 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  42.51 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  38.68 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  38.68 
 
 		 214 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  43 
 
 		 205 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5210  HylII  47.22 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611368  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4053  channel protein, hemolysin III family  41.46 
 
 		 220 aa  141  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.324319  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  43 
 
 		 205 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  38.05 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  42 
 
 		 205 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  37.56 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  36.68 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  43.78 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  41.18 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  42 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  41.5 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  41 
 
 		 205 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  37.85 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  40.7 
 
 		 204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  38.61 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  43.28 
 
 		 205 aa  134  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  41.87 
 
 		 208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  42.5 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  40.85 
 
 		 518 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  43.22 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  37.26 
 
 		 230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  39.59 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  40.81 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  37.67 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1550  channel protein, hemolysin III family  37.56 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561476  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  36.79 
 
 		 219 aa  125  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0157  HylII  44.38 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  40.5 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3228  channel protein, hemolysin III family  48.08 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  40.8 
 
 		 205 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  35.98 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  37.06 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  39.41 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  37.88 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  36.59 
 
 		 230 aa  121  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  33.02 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  37.06 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  37.06 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  34.78 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  38.81 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  38.42 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  38.42 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  38.42 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  38.42 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>