249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2738 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2738  channel protein, hemolysin III family  100 
 
 		 205 aa  403  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  97.07 
 
 		 205 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  84.88 
 
 		 205 aa  354  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5210  HylII  90.73 
 
 		 205 aa  331  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611368  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  64.88 
 
 		 206 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  64.88 
 
 		 206 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  65.85 
 
 		 206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  65.85 
 
 		 206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  65.85 
 
 		 206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  65.85 
 
 		 206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  65.85 
 
 		 206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  65.85 
 
 		 206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  65.85 
 
 		 206 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  64.88 
 
 		 206 aa  270  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  64.88 
 
 		 206 aa  270  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  63.9 
 
 		 206 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  63.9 
 
 		 206 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  63.9 
 
 		 206 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  63.41 
 
 		 206 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  63.41 
 
 		 206 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  63.41 
 
 		 206 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  58.05 
 
 		 206 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  59.31 
 
 		 205 aa  241  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  57.84 
 
 		 205 aa  239  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  58.33 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  57.35 
 
 		 205 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  57.84 
 
 		 205 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  56.86 
 
 		 205 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  58.82 
 
 		 205 aa  236  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  56.86 
 
 		 204 aa  234  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  59.31 
 
 		 205 aa  232  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  56.86 
 
 		 205 aa  230  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  56.37 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  56.37 
 
 		 205 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  54.41 
 
 		 205 aa  225  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  48.77 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  52.71 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  48.79 
 
 		 208 aa  194  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  51.26 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  50.75 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  48.56 
 
 		 208 aa  191  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  48.26 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  48.48 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  45.81 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4053  channel protein, hemolysin III family  50.51 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.324319  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0157  HylII  51.96 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3228  channel protein, hemolysin III family  51.24 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  46.5 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  44.67 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  43.22 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  46.77 
 
 		 518 aa  167  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  46.8 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  46.8 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  46.8 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  46.8 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  46.8 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  46.8 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  44.55 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  42.08 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  46.31 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  46.31 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  45.81 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  46.31 
 
 		 218 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  42.08 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  41.92 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  45.81 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3552  hemolysin III family channel protein  49.15 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1993  channel protein, hemolysin III family  45.05 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0837698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2360  channel protein, hemolysin III family  45.05 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0747  Hly-III family protein  44.28 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3992  channel protein, hemolysin III family  43 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000238096 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  43.69 
 
 		 215 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  42.29 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  41 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  48.74 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  42.29 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  43.2 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  41.18 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  40.5 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  42 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  41 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  41.83 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  141  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  38.54 
 
 		 213 aa  140  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  40.3 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  39.22 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  40.1 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  40.2 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  39.41 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  39.41 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  39.41 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  39.41 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  39.41 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  39.41 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  39.41 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  39.41 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  40.59 
 
 		 218 aa  137  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  39.41 
 
 		 219 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  40.89 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0531  hemolysin III  46 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.666008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>