More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0072 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  843    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  60.21 
 
 		 414 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  60.21 
 
 		 414 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  56.82 
 
 		 413 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  33.74 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  33.5 
 
 		 410 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  33.08 
 
 		 432 aa  192  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  31.54 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  30.55 
 
 		 390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  31.05 
 
 		 449 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  33.92 
 
 		 399 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  30.66 
 
 		 404 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  30.18 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 437 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  31.69 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  29.93 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  32.33 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  33.42 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  30.53 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  28.21 
 
 		 440 aa  173  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  30 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  30.33 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  32.66 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  32.26 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  31.65 
 
 		 395 aa  170  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  31.83 
 
 		 398 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  31.09 
 
 		 402 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  32.1 
 
 		 405 aa  169  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  30.43 
 
 		 425 aa  169  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  32.41 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  30.9 
 
 		 418 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  32.15 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  30.98 
 
 		 418 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  28.31 
 
 		 439 aa  166  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  31.26 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  31.82 
 
 		 418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  29.98 
 
 		 422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  30.9 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  29.59 
 
 		 422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  29.06 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.11 
 
 		 422 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  28.35 
 
 		 392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  28.78 
 
 		 439 aa  162  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  31.49 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  29.2 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  29.4 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  30.08 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  29 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  29.38 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  29.9 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  30.71 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  31.6 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  30.29 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  29.9 
 
 		 409 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  30.4 
 
 		 429 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  28.85 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  29.48 
 
 		 404 aa  159  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  29.9 
 
 		 409 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  29.41 
 
 		 414 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  27.95 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  30.27 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  30.6 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  27.14 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.52 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  29.67 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  29.1 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  29.11 
 
 		 434 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  29.97 
 
 		 387 aa  155  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  30.33 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  30.08 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  31 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.25 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  30.71 
 
 		 461 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  29.38 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  30.81 
 
 		 391 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  28.11 
 
 		 394 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  29.9 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  30.92 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  31.04 
 
 		 410 aa  153  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  29.1 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  30.87 
 
 		 394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  27.88 
 
 		 421 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 403 aa  152  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  28.96 
 
 		 413 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  28.28 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  31.47 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  28.28 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  27.99 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  29.75 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  30.14 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  28.64 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1632  phage integrase  28.26 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  hitchhiker  0.00880856 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  30.65 
 
 		 408 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  28.22 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  30.48 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  30.48 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  27.59 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  28.87 
 
 		 406 aa  150  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  30.2 
 
 		 406 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>