More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2103 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2129  hypothetical protein  94.25 
 
 
368 aa  703    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2103  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  733    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1099  HlyD family secretion protein  55.43 
 
 
401 aa  391  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0739  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 
371 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  44.07 
 
 
382 aa  290  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  43.2 
 
 
384 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  44.86 
 
 
406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  40.91 
 
 
371 aa  279  7e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5071  RND family efflux transporter MFP subunit  42.42 
 
 
377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212583  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4509  RND family efflux transporter MFP subunit  41.11 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4972  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.11 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.956167  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.86 
 
 
381 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815107  normal  0.264656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.34 
 
 
377 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  42.15 
 
 
385 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  41.02 
 
 
417 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3099  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  40.93 
 
 
414 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2967  secretion protein HlyD  40.93 
 
 
413 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.06 
 
 
392 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  44.64 
 
 
392 aa  262  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1567  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.08 
 
 
408 aa  259  6e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3425  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.33 
 
 
413 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2337  RND family efflux transporter MFP subunit  40.33 
 
 
413 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2511  RND family efflux transporter MFP subunit  40.61 
 
 
413 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504694  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1891  RND family efflux transporter MFP subunit  40.86 
 
 
391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.497754  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4124  RND family efflux transporter MFP subunit  37.17 
 
 
415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2448  RND family efflux transporter MFP subunit  40 
 
 
413 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.14 
 
 
391 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496799  normal  0.0176512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1073  RND family efflux transporter MFP subunit  37.67 
 
 
412 aa  248  9e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967621  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1145  RND family efflux transporter MFP subunit  37.67 
 
 
412 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00324803  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1077  RND family efflux transporter MFP subunit  37.67 
 
 
412 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3493  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE  37.67 
 
 
476 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2792  RND family efflux transporter MFP subunit  37.4 
 
 
412 aa  246  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32400  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  39.3 
 
 
414 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  38.94 
 
 
412 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2745  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  39.02 
 
 
414 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3182  RND family efflux transporter MFP subunit  37.11 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  41.69 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3325  RND family efflux transporter MFP subunit  37.11 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1187  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.11 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.917574  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3181  RND family efflux transporter MFP subunit  37.11 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  37.43 
 
 
405 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  37.43 
 
 
405 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  37.43 
 
 
405 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  41.32 
 
 
429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  37 
 
 
405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  37 
 
 
405 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  41.32 
 
 
399 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  40.66 
 
 
400 aa  242  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03218  Membrane-fusion protein  36.46 
 
 
428 aa  242  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  36.73 
 
 
405 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  40.12 
 
 
388 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0761316  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0042  secretion protein HlyD  38.27 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  41.48 
 
 
399 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  37.26 
 
 
411 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.26 
 
 
424 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3079  secretion protein HlyD  36.02 
 
 
418 aa  236  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.787711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3985  RND family efflux transporter MFP subunit  39.02 
 
 
410 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  37.94 
 
 
387 aa  236  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  37.64 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  37.64 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  37.64 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  37.64 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  37.64 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  36.59 
 
 
418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  37.64 
 
 
409 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  38.66 
 
 
404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  35.37 
 
 
408 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3373  RND family efflux transporter MFP subunit  38.33 
 
 
405 aa  233  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  39.7 
 
 
410 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2464  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.83 
 
 
390 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  39.75 
 
 
414 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5537  RND family efflux transporter MFP subunit  40.28 
 
 
400 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168619  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3621  secretion protein HlyD  40.28 
 
 
400 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4746  RND family efflux transporter MFP subunit  40.28 
 
 
400 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1004  HlyD family secretion protein  39.83 
 
 
414 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2293  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.72 
 
 
430 aa  227  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1112  transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  38.37 
 
 
438 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.680549 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33860  multidrug efflux RND membrane protein, HlyD family  38.24 
 
 
412 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.37 
 
 
436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4335  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.37 
 
 
436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1152  RND family efflux transporter MFP subunit  39.72 
 
 
426 aa  226  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.657671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  35.92 
 
 
392 aa  223  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4634  RND family efflux transporter MFP subunit  34.3 
 
 
429 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.24851 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  35.62 
 
 
393 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  36.29 
 
 
389 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5121  RND family efflux transporter MFP subunit  38.11 
 
 
396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.59 
 
 
436 aa  212  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  36.75 
 
 
393 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0902  RND family efflux transporter MFP subunit  36.99 
 
 
473 aa  209  8e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.864544  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4053  RND family efflux transporter MFP subunit  36.68 
 
 
414 aa  209  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.19 
 
 
396 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1792  secretion protein HlyD  35.08 
 
 
412 aa  205  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.567297  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  36.25 
 
 
396 aa  205  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  35.49 
 
 
396 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  33.23 
 
 
427 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0887  secretion protein HlyD  36.84 
 
 
398 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.49 
 
 
396 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  36.44 
 
 
430 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0869  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  32.93 
 
 
409 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.19 
 
 
419 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>