210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1648 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
360 aa  738    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0585  Oxidoreductase domain  75.21 
 
 
362 aa  553  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  61.34 
 
 
357 aa  466  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  62.88 
 
 
362 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1988  oxidoreductase domain-containing protein  61.71 
 
 
391 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0347113 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  52.96 
 
 
359 aa  404  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  54.82 
 
 
335 aa  378  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  51.97 
 
 
362 aa  378  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  54.08 
 
 
335 aa  368  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0267  oxidoreductase domain protein  49.71 
 
 
387 aa  348  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0049  oxidoreductase domain protein  47.48 
 
 
391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595236  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2442  oxidoreductase domain-containing protein  48.08 
 
 
342 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  47.58 
 
 
339 aa  298  9e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  45.29 
 
 
336 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  44.28 
 
 
336 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  44.68 
 
 
342 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  47.27 
 
 
338 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  40.9 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  32.17 
 
 
327 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1916  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0311153  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  26.03 
 
 
399 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  23.13 
 
 
667 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  23.41 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  23.41 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  25.95 
 
 
382 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2078  oxidoreductase domain protein  26.37 
 
 
329 aa  59.7  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
330 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  23.44 
 
 
328 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  23.4 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  25.21 
 
 
399 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.76 
 
 
356 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
375 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  26.55 
 
 
393 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  26.03 
 
 
396 aa  56.6  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 
358 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  24.6 
 
 
354 aa  56.6  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  26.74 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2113  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  24.01 
 
 
667 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  24.66 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
345 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.39 
 
 
349 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  24.68 
 
 
348 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 
341 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  28.12 
 
 
387 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  23.94 
 
 
320 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 
397 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 
365 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  23.9 
 
 
353 aa  53.5  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  24.7 
 
 
358 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  24.68 
 
 
349 aa  52.8  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  26.11 
 
 
374 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  30.07 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  23.55 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  24.31 
 
 
349 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.69 
 
 
312 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.85 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  24.38 
 
 
313 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.98 
 
 
335 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1238  oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 
393 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  23.87 
 
 
401 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  22.19 
 
 
362 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  24.03 
 
 
348 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  21.37 
 
 
667 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  25.52 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 
390 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 
338 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 
386 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 
347 aa  50.4  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  22.22 
 
 
389 aa  50.1  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  24.42 
 
 
345 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  24.35 
 
 
359 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 
337 aa  50.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  24.83 
 
 
378 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 
381 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  22 
 
 
374 aa  50.1  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 
344 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 
396 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 
376 aa  49.7  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  24.66 
 
 
366 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 
351 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  24.07 
 
 
351 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  22.73 
 
 
347 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  24.67 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  24.07 
 
 
351 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  25.57 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>