More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1048 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1048  ROK family protein  100 
 
 
361 aa  674    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4485  ROK family protein  54.69 
 
 
305 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117613  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0207  NagC family transcriptional regulator  40.2 
 
 
304 aa  179  8e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.602966  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3734  ROK family protein  49.16 
 
 
331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258087  decreased coverage  0.00194225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  34.68 
 
 
336 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  40.07 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  30.93 
 
 
322 aa  129  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  32.09 
 
 
347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.54 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  37.5 
 
 
326 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  37.32 
 
 
315 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  30.26 
 
 
391 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.36 
 
 
303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  28.28 
 
 
317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  28.53 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  40.45 
 
 
313 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  37.88 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  34.81 
 
 
300 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  36.01 
 
 
310 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1103  ROK family protein  32.3 
 
 
316 aa  113  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  34.29 
 
 
302 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  38.34 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  34.64 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  29.9 
 
 
315 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  29.1 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  35.69 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  33.59 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  32.36 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  30.64 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  32.36 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  35.28 
 
 
393 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  32.84 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  32.26 
 
 
327 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  32.58 
 
 
327 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  32.58 
 
 
327 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  32.58 
 
 
327 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  32.58 
 
 
327 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  32.58 
 
 
327 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  32.58 
 
 
327 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  32.58 
 
 
327 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0246  ROK family protein  38.46 
 
 
321 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  31.85 
 
 
322 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  27.48 
 
 
316 aa  109  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  34.22 
 
 
299 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  33.78 
 
 
352 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  33.01 
 
 
327 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  44.56 
 
 
318 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  37.3 
 
 
393 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  28.24 
 
 
291 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  32.43 
 
 
321 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  31.79 
 
 
315 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  35.93 
 
 
387 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  27.92 
 
 
317 aa  107  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  31.25 
 
 
389 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  32.64 
 
 
405 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  34.66 
 
 
328 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  37.87 
 
 
392 aa  106  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  34.95 
 
 
417 aa  106  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.18 
 
 
410 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  33.22 
 
 
342 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  33.96 
 
 
410 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  31.65 
 
 
372 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  35.53 
 
 
401 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  31.62 
 
 
298 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  31.82 
 
 
404 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  29.57 
 
 
478 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  31.68 
 
 
301 aa  104  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  32.59 
 
 
306 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  33.94 
 
 
363 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  29.51 
 
 
306 aa  103  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  38.97 
 
 
407 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  33.99 
 
 
323 aa  102  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  35.19 
 
 
317 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.98 
 
 
305 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  29.67 
 
 
312 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  31.7 
 
 
292 aa  101  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  32.14 
 
 
255 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2738  N-acetylglucosamine kinase  30.5 
 
 
304 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  33.01 
 
 
409 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0351  ROK family protein  31.48 
 
 
304 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000106958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  34.67 
 
 
395 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  29.66 
 
 
322 aa  101  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  34.1 
 
 
299 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  34.44 
 
 
314 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  29.47 
 
 
321 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.7 
 
 
304 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  33.57 
 
 
307 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  35.27 
 
 
306 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  34.35 
 
 
410 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  33.7 
 
 
429 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2107  6-phosphate glucose kinase  26.28 
 
 
298 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0287  ROK family protein  37.45 
 
 
320 aa  99.8  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.490636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  36.24 
 
 
429 aa  99.4  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  31.9 
 
 
323 aa  99.4  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.17 
 
 
300 aa  99  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  32.7 
 
 
303 aa  99  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  32.08 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.09 
 
 
304 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>