More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4132 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4132  ABC transporter related  100 
 
 
328 aa  632  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1708  ABC transporter related  46.01 
 
 
323 aa  232  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249646  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3748  ABC transporter related  45.53 
 
 
322 aa  195  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26967  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3439  ABC transporter related  44.32 
 
 
322 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3635  ABC transporter related  48.87 
 
 
322 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  0.045877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3152  ABC transporter related  42.95 
 
 
318 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  45 
 
 
325 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  36.57 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  39.74 
 
 
315 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0217  ABC transporter related  34.69 
 
 
310 aa  158  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.701871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00330  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.79 
 
 
311 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851117  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  33.55 
 
 
308 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.13 
 
 
321 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  35.96 
 
 
329 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  37.78 
 
 
311 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10190  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.76 
 
 
310 aa  153  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086698  normal  0.0445434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  36.13 
 
 
321 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  36.07 
 
 
309 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  36.07 
 
 
309 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.09 
 
 
312 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  29.76 
 
 
320 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  34.38 
 
 
306 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  38.75 
 
 
253 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  37.5 
 
 
320 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  35.55 
 
 
309 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  35.94 
 
 
245 aa  150  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  34.18 
 
 
355 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  42.06 
 
 
310 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  39.02 
 
 
320 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  40.51 
 
 
322 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  34.08 
 
 
319 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  36.41 
 
 
255 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  43.33 
 
 
341 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  33.87 
 
 
311 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  34.52 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  38.44 
 
 
342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.4 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.139774  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  36.27 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  33.44 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  34.31 
 
 
318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.41 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  40.44 
 
 
253 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  39.46 
 
 
337 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  36.89 
 
 
320 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  38.05 
 
 
253 aa  145  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  34.52 
 
 
306 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  33.44 
 
 
306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  36.27 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.92 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  37.67 
 
 
304 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  37.67 
 
 
304 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  37.61 
 
 
304 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  33.56 
 
 
315 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  37.33 
 
 
311 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  38.93 
 
 
333 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0417  ABC transporter related protein  41.36 
 
 
251 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  33.54 
 
 
308 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  33.76 
 
 
306 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  35.23 
 
 
304 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3112  ABC transporter, ATPase subunit  36.58 
 
 
310 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  32.64 
 
 
250 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.21 
 
 
362 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  33.12 
 
 
319 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.53 
 
 
312 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.41 
 
 
283 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0971989 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2017  ABC transporter related  43.38 
 
 
273 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  38.6 
 
 
337 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  36.32 
 
 
345 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 
253 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0617  ABC transporter related  41.71 
 
 
319 aa  144  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  32.7 
 
 
315 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  34.19 
 
 
308 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  39.09 
 
 
315 aa  142  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.14 
 
 
342 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  34.39 
 
 
318 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  39.04 
 
 
262 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  36.64 
 
 
355 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  34.25 
 
 
245 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  35.68 
 
 
311 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  44.44 
 
 
245 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  33.23 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3386  ABC transporter related  42.72 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  40.97 
 
 
251 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  34.89 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  29.22 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  34.58 
 
 
309 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5009  ABC transporter related  42.15 
 
 
253 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107476  normal  0.110297 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  35.89 
 
 
246 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  37.3 
 
 
300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  36.94 
 
 
373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2185  ABC transporter related  39.37 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.254877 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3493  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.644181  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  34.89 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3306  ABC transporter related  36.19 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  38.7 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  36.32 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0387  ABC transporter, ATP-binding protein; GldA-related gliding motility protein  31.06 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.225863  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.97 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  36.32 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>