More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3233 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  100 
 
 		 599 aa  1182    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.81 
 
 		 669 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  60.07 
 
 		 596 aa  719    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  62 
 
 		 620 aa  745    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  63.57 
 
 		 626 aa  721    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.47 
 
 		 669 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.47 
 
 		 669 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.47 
 
 		 669 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.98 
 
 		 669 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  58.38 
 
 		 596 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  64.58 
 
 		 581 aa  700    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  61.8 
 
 		 622 aa  669    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  62.77 
 
 		 620 aa  734    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  62.61 
 
 		 625 aa  732    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  60.07 
 
 		 605 aa  708    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  61.53 
 
 		 599 aa  721    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60.1 
 
 		 603 aa  723    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.47 
 
 		 663 aa  675    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  60.8 
 
 		 601 aa  748    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  61.58 
 
 		 600 aa  749    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  62.27 
 
 		 625 aa  727    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  63.62 
 
 		 600 aa  753    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.98 
 
 		 669 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.47 
 
 		 669 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  62.77 
 
 		 595 aa  698    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  62 
 
 		 620 aa  745    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  60.65 
 
 		 595 aa  674    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  58.63 
 
 		 572 aa  687    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  63.45 
 
 		 595 aa  715    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  62.33 
 
 		 620 aa  732    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  61.42 
 
 		 604 aa  736    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  62.33 
 
 		 620 aa  732    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  62 
 
 		 620 aa  745    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  55.46 
 
 		 630 aa  620  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4093  ABC transporter related  51.8 
 
 		 585 aa  548  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  48.38 
 
 		 598 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  49.48 
 
 		 596 aa  518  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  48.29 
 
 		 593 aa  511  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  39.35 
 
 		 591 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.09 
 
 		 595 aa  332  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.63 
 
 		 621 aa  325  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.87 
 
 		 621 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.87 
 
 		 589 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  38.87 
 
 		 621 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.87 
 
 		 621 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.87 
 
 		 621 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.87 
 
 		 621 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.87 
 
 		 621 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  39.31 
 
 		 637 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  39.31 
 
 		 637 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  39.27 
 
 		 663 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  39.31 
 
 		 637 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  39.07 
 
 		 636 aa  320  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  39.1 
 
 		 637 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  38.16 
 
 		 609 aa  316  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  37.14 
 
 		 630 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  35.23 
 
 		 593 aa  310  4e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  38.95 
 
 		 587 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.71 
 
 		 598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  35.08 
 
 		 603 aa  306  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  38.9 
 
 		 623 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  36.38 
 
 		 597 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  35.27 
 
 		 603 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1493  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.63 
 
 		 621 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246296  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  43.1 
 
 		 599 aa  303  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0616  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  35.21 
 
 		 591 aa  301  2e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.146496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2203  ABC transporter related  33.39 
 
 		 567 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  36.94 
 
 		 587 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  37.88 
 
 		 643 aa  301  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  36.74 
 
 		 597 aa  300  5e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  42.37 
 
 		 593 aa  300  6e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  41.89 
 
 		 594 aa  300  6e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  34.34 
 
 		 610 aa  300  7e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  35.7 
 
 		 606 aa  300  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  35.25 
 
 		 582 aa  298  1e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  34.55 
 
 		 610 aa  299  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  37.02 
 
 		 621 aa  298  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1142  ABC transporter related  34.06 
 
 		 585 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  53.23 
 
 		 621 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3210  ABC transporter related  37.4 
 
 		 587 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.461099  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  35.56 
 
 		 606 aa  296  5e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  37.07 
 
 		 589 aa  296  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.49 
 
 		 629 aa  296  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  35.87 
 
 		 587 aa  296  8e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  34.11 
 
 		 612 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  37.65 
 
 		 633 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  33.95 
 
 		 612 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  36.1 
 
 		 606 aa  295  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0942  ABC transporter related  37.76 
 
 		 622 aa  294  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  34.47 
 
 		 587 aa  293  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  37.47 
 
 		 595 aa  293  7e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  36.62 
 
 		 640 aa  293  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  33.83 
 
 		 672 aa  293  7e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  37.62 
 
 		 603 aa  292  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  36.08 
 
 		 621 aa  292  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  36.16 
 
 		 622 aa  292  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  35.55 
 
 		 626 aa  292  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  36.26 
 
 		 599 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.59 
 
 		 605 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  37.32 
 
 		 587 aa  292  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>