40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4945 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  80 
 
 		 1242 aa  1439    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  100 
 
 		 1128 aa  2177    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  38.18 
 
 		 1200 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  36.37 
 
 		 1198 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  38.81 
 
 		 1201 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  48.01 
 
 		 939 aa  300  9e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  40.94 
 
 		 1207 aa  296  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  38.1 
 
 		 949 aa  287  7e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  39.5 
 
 		 938 aa  274  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  38.07 
 
 		 957 aa  269  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  41.34 
 
 		 1093 aa  266  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  39.08 
 
 		 902 aa  261  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  36.31 
 
 		 973 aa  259  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  38.6 
 
 		 953 aa  257  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  40.76 
 
 		 1139 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  41 
 
 		 1133 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  42.42 
 
 		 903 aa  245  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  39.57 
 
 		 1146 aa  244  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  34.88 
 
 		 946 aa  232  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  40.94 
 
 		 1133 aa  229  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  40.83 
 
 		 1130 aa  228  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  40.83 
 
 		 1155 aa  228  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  40.83 
 
 		 1124 aa  227  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  40.9 
 
 		 989 aa  218  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  39.36 
 
 		 891 aa  211  8e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  39.18 
 
 		 941 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  39.47 
 
 		 774 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  23.37 
 
 		 778 aa  117  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  30.96 
 
 		 1045 aa  111  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  23.74 
 
 		 833 aa  104  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  27.86 
 
 		 587 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  25.71 
 
 		 600 aa  101  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  27.19 
 
 		 824 aa  97.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  32.78 
 
 		 1312 aa  90.9  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  24.94 
 
 		 823 aa  91.3  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  26.88 
 
 		 921 aa  82  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  33.97 
 
 		 920 aa  57  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  25.94 
 
 		 934 aa  48.1  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  29.13 
 
 		 899 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  25.51 
 
 		 939 aa  48.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>