180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5446 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 		 415 aa  847    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  70.84 
 
 		 407 aa  557  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  55.14 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  49.02 
 
 		 371 aa  298  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  48.25 
 
 		 316 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  48.25 
 
 		 313 aa  289  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  48.25 
 
 		 313 aa  289  8e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  48.25 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  48.25 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  48.41 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  48.41 
 
 		 312 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  46.67 
 
 		 316 aa  279  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  46.36 
 
 		 316 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  45.76 
 
 		 350 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  47.54 
 
 		 313 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  47.99 
 
 		 322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  44.35 
 
 		 352 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  47.08 
 
 		 312 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  44.29 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  43.94 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  44.19 
 
 		 332 aa  259  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  45.95 
 
 		 310 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  43.37 
 
 		 308 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  43.2 
 
 		 302 aa  246  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  43.98 
 
 		 303 aa  245  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  42.9 
 
 		 304 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  43.2 
 
 		 303 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  41.64 
 
 		 362 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  43.28 
 
 		 308 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  43.54 
 
 		 304 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  43.87 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  43.98 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  43.67 
 
 		 296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  39.8 
 
 		 368 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  41.01 
 
 		 363 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  42.9 
 
 		 304 aa  232  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  40.68 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  43.07 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.96 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  39.39 
 
 		 372 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  40.99 
 
 		 343 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  41.82 
 
 		 307 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  43.4 
 
 		 307 aa  220  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  41.79 
 
 		 299 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  42.6 
 
 		 304 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  40.74 
 
 		 302 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  38.82 
 
 		 328 aa  206  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  39.13 
 
 		 323 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  38.51 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  38.37 
 
 		 304 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  33.33 
 
 		 533 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  37.1 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  36.08 
 
 		 286 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  31.42 
 
 		 338 aa  169  9e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  36.59 
 
 		 287 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  33.98 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  30.82 
 
 		 338 aa  166  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  36.91 
 
 		 281 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  37.92 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  36.13 
 
 		 281 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  35.24 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  34.77 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  36.14 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  33.71 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  35.06 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  60.83 
 
 		 131 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  60.83 
 
 		 131 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  32.13 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  32.7 
 
 		 334 aa  146  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  32.72 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  31.61 
 
 		 338 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  31.36 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  40.45 
 
 		 183 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  40.45 
 
 		 183 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  28.53 
 
 		 340 aa  126  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  28.7 
 
 		 545 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  34.15 
 
 		 247 aa  124  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.33 
 
 		 306 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.37 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.06 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  29.26 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  44.14 
 
 		 197 aa  110  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  28.81 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  35.02 
 
 		 353 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.14 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  24.8 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  30.13 
 
 		 477 aa  73.2  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  28.09 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.28 
 
 		 581 aa  69.7  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.08 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2715  gluconolactonase-like protein  36 
 
 		 123 aa  64.3  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  25.59 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1725  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.42 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000166829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.76 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.31 
 
 		 579 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.31 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.72 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  28.02 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.87 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  26.82 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.875463 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>