More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4309 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  100 
 
 		 378 aa  764    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  58.2 
 
 		 383 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  41.09 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  37.96 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.38 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  38.73 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  38.18 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  37.83 
 
 		 412 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  37.14 
 
 		 413 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  37.41 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  36.84 
 
 		 406 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  36.39 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.45 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  36.39 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  38.52 
 
 		 401 aa  226  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  37.47 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  37.15 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  35.46 
 
 		 388 aa  222  9e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  38.11 
 
 		 386 aa  222  9e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  36.43 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  38.2 
 
 		 387 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  35.94 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  35.94 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  35.94 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  37.24 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  37.8 
 
 		 382 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  37.37 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  35.28 
 
 		 390 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  35.27 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  37.24 
 
 		 394 aa  212  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  36.44 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  37.12 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  37.44 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  36.46 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  35.19 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  34.82 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.98 
 
 		 392 aa  209  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  37.92 
 
 		 384 aa  206  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  37.11 
 
 		 395 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  36.06 
 
 		 396 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  38.44 
 
 		 409 aa  205  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.02 
 
 		 392 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  38.38 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  38.38 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.46 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  34.74 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  37.86 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  35.4 
 
 		 395 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  39.1 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  38.76 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  35.97 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.76 
 
 		 392 aa  202  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  34.28 
 
 		 395 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  36.39 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  33.67 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  37.08 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  33.89 
 
 		 421 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  36.39 
 
 		 383 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  36.52 
 
 		 387 aa  199  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  35.95 
 
 		 388 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  34.32 
 
 		 390 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  36.65 
 
 		 393 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  35.71 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  38.52 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  35.49 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  36.84 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  37.11 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  36.27 
 
 		 387 aa  193  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.76 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  36.22 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  34.91 
 
 		 383 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  38.37 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  35.79 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  35.48 
 
 		 386 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  34.95 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  34.95 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  34.95 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  33.59 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  32.89 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  34.42 
 
 		 390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  35.88 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  36.1 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  34.37 
 
 		 392 aa  181  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  35.22 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  34.37 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  35.22 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  35.22 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  34.43 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.68 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  36.9 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  37.46 
 
 		 393 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  35.5 
 
 		 384 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  38.48 
 
 		 398 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  33.25 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  36.1 
 
 		 402 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  33.9 
 
 		 417 aa  179  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  37.5 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  37.5 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>