169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06660 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  373  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  85.54 
 
 		 166 aa  285  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  68.67 
 
 		 165 aa  228  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  64.47 
 
 		 161 aa  187  8e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  64.1 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  71.43 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  67.67 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  66.67 
 
 		 163 aa  174  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  66.92 
 
 		 187 aa  174  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  55.15 
 
 		 160 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  69.17 
 
 		 141 aa  164  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  65.41 
 
 		 134 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  53.01 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  47.22 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  58.65 
 
 		 156 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  58.65 
 
 		 156 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  48.04 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  61.81 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  62.69 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  59.85 
 
 		 133 aa  148  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  55.32 
 
 		 178 aa  147  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  46.11 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  51.15 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  55.47 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  58.33 
 
 		 133 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  56.82 
 
 		 133 aa  143  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  54.68 
 
 		 194 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  49.39 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  52.94 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  51.85 
 
 		 279 aa  139  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  56.06 
 
 		 151 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  55.3 
 
 		 133 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  55.3 
 
 		 133 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  57.89 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  47.83 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  50.37 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  54.11 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  49.71 
 
 		 191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  55.17 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  53.38 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  49.25 
 
 		 261 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  51.7 
 
 		 190 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  51.7 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  51.7 
 
 		 190 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  53.38 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  59.7 
 
 		 157 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  50.68 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  52.05 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  47.95 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  51.88 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  48.15 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  53.1 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  50.34 
 
 		 184 aa  125  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  45.59 
 
 		 558 aa  124  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  51.02 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  49.66 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  44.69 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  48.98 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  48.98 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  51.02 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  50.38 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  47.68 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  49.34 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  48.65 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  49.62 
 
 		 160 aa  118  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  50.68 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  48.68 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  46.05 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  39.77 
 
 		 596 aa  113  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  39.77 
 
 		 202 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  43.59 
 
 		 161 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  41.01 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  46.04 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  50.37 
 
 		 611 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  44.22 
 
 		 210 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  39.85 
 
 		 134 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  43.75 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  39.85 
 
 		 134 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.98 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  38.52 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.81 
 
 		 308 aa  104  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  38.92 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  37.59 
 
 		 134 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  46 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  46.34 
 
 		 163 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  42.45 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  46.34 
 
 		 163 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  41.86 
 
 		 215 aa  96.3  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  46.92 
 
 		 315 aa  96.7  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  39.72 
 
 		 217 aa  95.9  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  41.73 
 
 		 142 aa  94.7  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17100  secreted/surface protein with fasciclin-like repeats  42.76 
 
 		 235 aa  94.4  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  39.13 
 
 		 225 aa  93.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  30.6 
 
 		 141 aa  93.6  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  44.22 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0159  beta-Ig-H3/fasciclin  41.56 
 
 		 226 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2284  beta-Ig-H3/fasciclin  42.21 
 
 		 229 aa  92  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000481809 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  35.44 
 
 		 272 aa  92  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  33.83 
 
 		 157 aa  91.7  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>