65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05915 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  87.13 
 
 		 544 aa  1006    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  100 
 
 		 544 aa  1129    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  73.53 
 
 		 543 aa  809    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  58.97 
 
 		 554 aa  639    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  44.75 
 
 		 554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  44.28 
 
 		 555 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  44.28 
 
 		 555 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  44.28 
 
 		 555 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  44.46 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.7 
 
 		 552 aa  415  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  43.74 
 
 		 553 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.42 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  43.42 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  43.42 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  43.42 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  43.42 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  43.42 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  42.81 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  42.81 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  42.81 
 
 		 552 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  42.81 
 
 		 552 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  42.81 
 
 		 552 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  43.42 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  43.27 
 
 		 552 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  43.42 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  42.11 
 
 		 554 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  42.47 
 
 		 554 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  38.32 
 
 		 558 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.77 
 
 		 566 aa  247  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.38 
 
 		 647 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  23.19 
 
 		 607 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  24.52 
 
 		 574 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  31.14 
 
 		 598 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.77 
 
 		 640 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  24.19 
 
 		 669 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.1 
 
 		 594 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  22.73 
 
 		 685 aa  59.3  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  26.44 
 
 		 553 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  28.99 
 
 		 613 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 645 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  25.68 
 
 		 594 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  29.31 
 
 		 596 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  41.54 
 
 		 626 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  28.86 
 
 		 695 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  27.15 
 
 		 682 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.8 
 
 		 639 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  23.39 
 
 		 564 aa  49.3  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  30.77 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  33.72 
 
 		 382 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  30.77 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  48.98 
 
 		 606 aa  48.5  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  41.54 
 
 		 586 aa  48.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  28.65 
 
 		 650 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  26.61 
 
 		 513 aa  46.6  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  24.64 
 
 		 703 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  43.08 
 
 		 714 aa  47  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.48 
 
 		 605 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  29.03 
 
 		 666 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  45.65 
 
 		 530 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  34.43 
 
 		 604 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  23.86 
 
 		 784 aa  44.3  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  28.1 
 
 		 758 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  25.13 
 
 		 707 aa  43.9  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  40.82 
 
 		 641 aa  43.9  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.24 
 
 		 626 aa  43.5  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>