79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00688 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00688  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  654    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0278  O-antigen length determinant protein  56.7 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0795  lipopolysaccharide biosynthesis protein  55.95 
 
 		 315 aa  364  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3191  chain length determinant protein  53.11 
 
 		 329 aa  349  4e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  52.75 
 
 		 328 aa  348  9e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  51.96 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  51.24 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1384  lipopolysaccharide biosynthesis  51.74 
 
 		 324 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00868672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2541  lipopolysaccharide biosynthesis  50.93 
 
 		 329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2841  lipopolysaccharide biosynthesis  52.16 
 
 		 326 aa  334  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2902  lipopolysaccharide biosynthesis protein  52.16 
 
 		 324 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3033  lipopolysaccharide biosynthesis protein  52.6 
 
 		 320 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1653  lipopolysaccharide biosynthesis protein  52.16 
 
 		 321 aa  328  6e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0595159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2891  lipopolysaccharide biosynthesis protein  52.32 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1397  lipopolysaccharide biosynthesis protein  53.51 
 
 		 325 aa  326  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1376  lipopolysaccharide biosynthesis  53.38 
 
 		 318 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648353  hitchhiker  0.00000667322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0764  lipopolysaccharide biosynthesis  49.36 
 
 		 307 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0283751  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2669  lipopolysaccharide biosynthesis  50.65 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2090  chain length determinant family protein  49.16 
 
 		 322 aa  295  5e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.77217  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2262  chain length determinant protein  50.99 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0523506  decreased coverage  0.000488654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2975  chain length determinant family protein  40.27 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2132  chain length determinant protein  41.25 
 
 		 340 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.29 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  36.36 
 
 		 721 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  36.79 
 
 		 716 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0472  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.31 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.21 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0370  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.24 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.59 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1674  lipopolysaccharide biosynthesis  23.27 
 
 		 364 aa  52.8  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  34.31 
 
 		 747 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0642  ferric enterobactin transport protein FepE  32.99 
 
 		 378 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.412553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0685  ferric enterobactin transport protein FepE  32.99 
 
 		 378 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  40 
 
 		 723 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.83 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  45 
 
 		 724 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.26 
 
 		 463 aa  49.7  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1888  hypothetical protein  22.03 
 
 		 343 aa  49.7  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.173823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  30.91 
 
 		 388 aa  49.7  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1985  chain length determinant domain-containing protein  24.27 
 
 		 405 aa  49.3  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0628  ferric enterobactin transport protein FepE  31.96 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2625  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00623391  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  34.75 
 
 		 730 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  32.26 
 
 		 745 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0701  ferric enterobactin transport protein FepE  31.96 
 
 		 378 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0643  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.82 
 
 		 398 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1960  putative transport-related membrane protein  23.43 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  23.68 
 
 		 406 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0661  chain length determinant protein  23.43 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0567  chain length determinant protein  23.43 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0747  ferric enterobactin transport protein FepE  35.06 
 
 		 378 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  34.26 
 
 		 720 aa  47  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  34.26 
 
 		 720 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 		 746 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3789  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 407 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23360  O-antigen chain length regulator  36.23 
 
 		 360 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000253152  hitchhiker  0.00753817 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0419  chain length determinant protein  45.9 
 
 		 370 aa  46.6  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.554474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  27 
 
 		 708 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  33.33 
 
 		 720 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 		 720 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 720 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2347  lipopolysaccharide biosynthesis  22.87 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000937745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  33.33 
 
 		 720 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  27.96 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  33.33 
 
 		 720 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  33.33 
 
 		 720 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  33.33 
 
 		 720 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  40.82 
 
 		 719 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0945  lipopolysaccharide biosynthesis  31.25 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0490  ferric enterobactin transport protein FepE  27.96 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  40.82 
 
 		 719 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  40.82 
 
 		 719 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  40.82 
 
 		 719 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1969  O-antigen chain length regulator  28.36 
 
 		 349 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  31.82 
 
 		 726 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  38.3 
 
 		 723 aa  42.7  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  36.54 
 
 		 779 aa  43.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2221  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  37.5 
 
 		 489 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120089  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0789  lipopolysaccharide biosynthesis  38.24 
 
 		 408 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>