80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1397 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1397  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 325 aa  672    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  81.76 
 
 		 324 aa  550  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1653  lipopolysaccharide biosynthesis protein  82.04 
 
 		 321 aa  534  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0595159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3191  chain length determinant protein  74.7 
 
 		 329 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1384  lipopolysaccharide biosynthesis  76.22 
 
 		 324 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00868672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2541  lipopolysaccharide biosynthesis  75.61 
 
 		 329 aa  519  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  75.3 
 
 		 328 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  74.77 
 
 		 328 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3033  lipopolysaccharide biosynthesis protein  74.46 
 
 		 320 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2891  lipopolysaccharide biosynthesis protein  77.44 
 
 		 325 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2902  lipopolysaccharide biosynthesis protein  73.09 
 
 		 324 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2841  lipopolysaccharide biosynthesis  72.7 
 
 		 326 aa  495  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500509  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1376  lipopolysaccharide biosynthesis  74.38 
 
 		 318 aa  484  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648353  hitchhiker  0.00000667322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2669  lipopolysaccharide biosynthesis  71.47 
 
 		 324 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2262  chain length determinant protein  70.39 
 
 		 327 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0523506  decreased coverage  0.000488654 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0795  lipopolysaccharide biosynthesis protein  56.15 
 
 		 315 aa  364  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0278  O-antigen length determinant protein  54.26 
 
 		 325 aa  362  5.0000000000000005e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0764  lipopolysaccharide biosynthesis  52.61 
 
 		 307 aa  330  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0283751  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00688  hypothetical protein  53.51 
 
 		 320 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2090  chain length determinant family protein  55 
 
 		 322 aa  321  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.77217  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2132  chain length determinant protein  43.62 
 
 		 340 aa  276  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2975  chain length determinant family protein  41.53 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0472  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  30.91 
 
 		 716 aa  60.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  22.69 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0643  lipopolysaccharide biosynthesis protein  45.45 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.48 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  32.41 
 
 		 721 aa  56.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3789  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.03 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2625  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00623391  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  23.95 
 
 		 803 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1888  hypothetical protein  22.22 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.173823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2347  lipopolysaccharide biosynthesis  25.66 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000937745  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  21.89 
 
 		 388 aa  49.7  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  39.34 
 
 		 723 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3039  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.85 
 
 		 377 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.443281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3057  ferric enterobactin transport protein FepE  33.85 
 
 		 377 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0638  ferric enterobactin transport protein FepE  33.85 
 
 		 377 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00554  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  33.85 
 
 		 377 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00543  hypothetical protein  33.85 
 
 		 377 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.589908  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0673  ferric enterobactin transport protein FepE  33.85 
 
 		 377 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0661  chain length determinant protein  21.83 
 
 		 405 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1960  putative transport-related membrane protein  21.83 
 
 		 405 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0567  chain length determinant protein  21.83 
 
 		 405 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  28.42 
 
 		 377 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0490  ferric enterobactin transport protein FepE  28.42 
 
 		 377 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1257  ferric enterobactin transport protein FepE  35 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000394328  hitchhiker  0.0000000226828 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  32.31 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22900  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0419  chain length determinant protein  43.75 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.554474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  39.34 
 
 		 724 aa  47  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3948  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.03 
 
 		 365 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0315  chain length determinant protein-like protein  44.74 
 
 		 347 aa  47  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  21.07 
 
 		 797 aa  47  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  36.36 
 
 		 747 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1985  chain length determinant domain-containing protein  22.77 
 
 		 405 aa  45.8  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  33.33 
 
 		 720 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3036  ferric enterobactin transport protein FepE  33.75 
 
 		 383 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.177075  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4936  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.11 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0428435  normal  0.874346 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0945  lipopolysaccharide biosynthesis  32 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3177  ferric enterobactin transport protein FepE  33.75 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  38.3 
 
 		 723 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1234  lipopolysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  35.53 
 
 		 759 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  37.93 
 
 		 726 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0370  lipopolysaccharide biosynthesis protein  18.68 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  33.33 
 
 		 720 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  33.33 
 
 		 720 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  33.33 
 
 		 720 aa  43.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  33.33 
 
 		 720 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  33.33 
 
 		 720 aa  43.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  33.33 
 
 		 720 aa  43.1  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 720 aa  43.1  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1768  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.85 
 
 		 297 aa  42.7  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0628  ferric enterobactin transport protein FepE  36.84 
 
 		 378 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0747  ferric enterobactin transport protein FepE  36.84 
 
 		 378 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>