41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0945 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0945  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22900  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 328 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0357  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  23.36 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0791  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 		 653 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2715  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158503  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3033  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  23.16 
 
 		 624 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2541  lipopolysaccharide biosynthesis  21.7 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22890  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.4 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1768  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  30.14 
 
 		 464 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1384  lipopolysaccharide biosynthesis  22.5 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00868672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  25.2 
 
 		 605 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1653  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 321 aa  52.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0595159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3191  chain length determinant protein  22.84 
 
 		 329 aa  52.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0419  chain length determinant protein  23.18 
 
 		 370 aa  52.8  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.554474  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1376  lipopolysaccharide biosynthesis  32.53 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648353  hitchhiker  0.00000667322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  22.17 
 
 		 487 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2090  chain length determinant family protein  21.77 
 
 		 322 aa  49.3  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.77217  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2891  lipopolysaccharide biosynthesis protein  43.14 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  45 
 
 		 653 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0795  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  26.07 
 
 		 745 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2110  hypothetical protein  31.46 
 
 		 411 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.730509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2274  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.44 
 
 		 315 aa  45.8  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00688  hypothetical protein  31.25 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.03 
 
 		 800 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  55 
 
 		 755 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  35.9 
 
 		 435 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2841  lipopolysaccharide biosynthesis  37.88 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2902  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1674  lipopolysaccharide biosynthesis  41.67 
 
 		 364 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 463 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  27.54 
 
 		 788 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0076  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.853299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  22.84 
 
 		 509 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0074  chain length determinant family protein  24.71 
 
 		 336 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2669  lipopolysaccharide biosynthesis  22.96 
 
 		 324 aa  42.7  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>