56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1768 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1768  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 297 aa  587  1e-167  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0419  chain length determinant protein  34.01 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.554474  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0945  lipopolysaccharide biosynthesis  21 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  22.05 
 
 		 328 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1571  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.33 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.647884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2541  lipopolysaccharide biosynthesis  22.08 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3033  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1384  lipopolysaccharide biosynthesis  22.36 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00868672 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  39.22 
 
 		 726 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  39.22 
 
 		 726 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.59 
 
 		 736 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  39.22 
 
 		 726 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  39.22 
 
 		 726 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  39.22 
 
 		 726 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  39.22 
 
 		 726 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  39.22 
 
 		 726 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3191  chain length determinant protein  21.27 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  39.22 
 
 		 726 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0626  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.26 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  46.51 
 
 		 740 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  33.33 
 
 		 723 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2274  lipopolysaccharide biosynthesis protein  43.28 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2902  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.42 
 
 		 324 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  42.31 
 
 		 716 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  35.48 
 
 		 722 aa  47  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  34.69 
 
 		 723 aa  46.6  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  34.38 
 
 		 720 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  34.38 
 
 		 720 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  34.38 
 
 		 720 aa  46.6  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  34.38 
 
 		 720 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  34.38 
 
 		 720 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  34.38 
 
 		 720 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  44.19 
 
 		 740 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  34.38 
 
 		 720 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  34.38 
 
 		 720 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  25.15 
 
 		 721 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  34.69 
 
 		 724 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0074  chain length determinant family protein  20.77 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.46 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0076  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.853299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  36.73 
 
 		 720 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  31.75 
 
 		 719 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2722  lipopolysaccharide biosynthesis  22.46 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.728729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  31.75 
 
 		 719 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  31.75 
 
 		 719 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  31.75 
 
 		 719 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2026  hypothetical protein  28.57 
 
 		 178 aa  42.7  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1653  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.54 
 
 		 321 aa  42.7  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0595159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1376  lipopolysaccharide biosynthesis  38.78 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648353  hitchhiker  0.00000667322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2891  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.29 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  34.69 
 
 		 724 aa  42.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  34 
 
 		 435 aa  42.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  23.98 
 
 		 735 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  32.76 
 
 		 726 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>