32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2026 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2026  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  347  5e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.8 
 
 		 720 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  30.19 
 
 		 720 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  30.19 
 
 		 720 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  30.19 
 
 		 720 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  30.19 
 
 		 720 aa  45.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.2 
 
 		 780 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  30.19 
 
 		 720 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  30.19 
 
 		 720 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  30.19 
 
 		 720 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  25.79 
 
 		 723 aa  45.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  29.25 
 
 		 719 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  29.25 
 
 		 719 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  29.25 
 
 		 719 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  29.25 
 
 		 719 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  29.25 
 
 		 719 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  30.19 
 
 		 720 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  28.3 
 
 		 720 aa  44.7  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4163  lipopolysaccharide biosynthesis  30.77 
 
 		 748 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.214287  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4203  lipopolysaccharide biosynthesis  30.77 
 
 		 748 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.16 
 
 		 477 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 		 735 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  25.74 
 
 		 741 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.71 
 
 		 477 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  32.35 
 
 		 478 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1768  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 297 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  21.95 
 
 		 796 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2715  lipopolysaccharide biosynthesis protein  47.92 
 
 		 341 aa  42.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158503  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  25.34 
 
 		 518 aa  41.2  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.44 
 
 		 736 aa  41.2  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  28.77 
 
 		 784 aa  41.2  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  25.17 
 
 		 784 aa  40.8  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>