60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1888 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1888  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  682    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.173823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3789  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.36 
 
 		 407 aa  239  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1885  hypothetical protein  40.41 
 
 		 370 aa  233  5e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1234  lipopolysaccharide biosynthesis  42.47 
 
 		 388 aa  225  9e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.13 
 
 		 384 aa  216  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.66 
 
 		 422 aa  215  8e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.03 
 
 		 396 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  36.16 
 
 		 409 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.23 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0643  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.29 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2731  lipopolysaccharide biosynthesis  33.63 
 
 		 394 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  32.4 
 
 		 388 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  31.55 
 
 		 406 aa  172  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1346  lipopolysaccharide biosynthesis  33.42 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3061  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.21 
 
 		 416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1985  chain length determinant domain-containing protein  31.08 
 
 		 405 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1960  putative transport-related membrane protein  28.85 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0567  chain length determinant protein  28.85 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0661  chain length determinant protein  28.85 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0789  lipopolysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.85 
 
 		 463 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0889  lipopolysaccharide biosynthesis  27.07 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.6181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2625  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00623391  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2541  lipopolysaccharide biosynthesis  22.62 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3033  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2902  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3191  chain length determinant protein  22.07 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1653  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0595159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  22.22 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1384  lipopolysaccharide biosynthesis  21.23 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00868672 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0278  O-antigen length determinant protein  24.79 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2891  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.29 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00688  hypothetical protein  24.24 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1376  lipopolysaccharide biosynthesis  22.02 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648353  hitchhiker  0.00000667322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0795  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 315 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1397  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0764  lipopolysaccharide biosynthesis  24.45 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0283751  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2841  lipopolysaccharide biosynthesis  19.89 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500509  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0889  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.46 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4936  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 362 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0428435  normal  0.874346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0472  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  25.96 
 
 		 487 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  31.4 
 
 		 747 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2669  lipopolysaccharide biosynthesis  20 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2090  chain length determinant family protein  23.32 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.77217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.89 
 
 		 474 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 		 653 aa  47  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  21.21 
 
 		 740 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2262  chain length determinant protein  23.32 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0523506  decreased coverage  0.000488654 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2274  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.48 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.13 
 
 		 720 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  29.13 
 
 		 723 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2715  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158503  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.61 
 
 		 671 aa  43.1  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  27.52 
 
 		 797 aa  43.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  29.55 
 
 		 770 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  27.66 
 
 		 624 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  24.48 
 
 		 469 aa  42.4  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>