31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2132 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2132  chain length determinant protein  100 
 
 		 340 aa  693    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  46.15 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3191  chain length determinant protein  43.65 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  45.18 
 
 		 328 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1384  lipopolysaccharide biosynthesis  44.78 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00868672 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3033  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.44 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2541  lipopolysaccharide biosynthesis  43 
 
 		 329 aa  275  8e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.48 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2902  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.95 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2891  lipopolysaccharide biosynthesis protein  45.45 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2841  lipopolysaccharide biosynthesis  43.67 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2090  chain length determinant family protein  44.44 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.77217  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1376  lipopolysaccharide biosynthesis  43.53 
 
 		 318 aa  256  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648353  hitchhiker  0.00000667322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1653  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.44 
 
 		 321 aa  256  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0595159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0764  lipopolysaccharide biosynthesis  41.45 
 
 		 307 aa  252  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0283751  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1397  lipopolysaccharide biosynthesis protein  43.77 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0795  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.8 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0278  O-antigen length determinant protein  37.15 
 
 		 325 aa  243  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2262  chain length determinant protein  41.12 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0523506  decreased coverage  0.000488654 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00688  hypothetical protein  40.85 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2669  lipopolysaccharide biosynthesis  43.67 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2975  chain length determinant family protein  35.57 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  28.1 
 
 		 803 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.36 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0472  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.35 
 
 		 355 aa  52.8  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 		 388 aa  52.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.47 
 
 		 463 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.6 
 
 		 409 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  20.43 
 
 		 406 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  24.52 
 
 		 803 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>