123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2625 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2625  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 403 aa  805    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00623391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  36.9 
 
 		 409 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.01 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  31.83 
 
 		 406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.47 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.86 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  29.05 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0889  lipopolysaccharide biosynthesis  27.14 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.6181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.33 
 
 		 384 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3061  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.89 
 
 		 416 aa  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0789  lipopolysaccharide biosynthesis  25.83 
 
 		 408 aa  116  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1346  lipopolysaccharide biosynthesis  30.68 
 
 		 401 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3789  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.71 
 
 		 407 aa  116  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1960  putative transport-related membrane protein  26.58 
 
 		 405 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954505  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0661  chain length determinant protein  26.58 
 
 		 405 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0567  chain length determinant protein  26.58 
 
 		 405 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1985  chain length determinant domain-containing protein  26.8 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2731  lipopolysaccharide biosynthesis  31 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1234  lipopolysaccharide biosynthesis  30.04 
 
 		 388 aa  86.3  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0643  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.79 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1888  hypothetical protein  25.41 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.173823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  23.98 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 		 324 aa  66.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1384  lipopolysaccharide biosynthesis  24.54 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00868672 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2891  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00688  hypothetical protein  24.14 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2541  lipopolysaccharide biosynthesis  35.35 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3191  chain length determinant protein  38 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2841  lipopolysaccharide biosynthesis  24.22 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500509  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1376  lipopolysaccharide biosynthesis  23.58 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648353  hitchhiker  0.00000667322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  25.35 
 
 		 750 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3033  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.2 
 
 		 726 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2902  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  24.84 
 
 		 372 aa  57  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  26.05 
 
 		 744 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0775  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.79 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0816  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.36 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.671336  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  23.03 
 
 		 719 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0622  capsular polysaccharide ABC transporter  25.86 
 
 		 367 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.22942 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25 
 
 		 736 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  25.73 
 
 		 730 aa  53.9  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  22.54 
 
 		 719 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  22.54 
 
 		 719 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  22.54 
 
 		 719 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  23.25 
 
 		 745 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  20.77 
 
 		 719 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0278  O-antigen length determinant protein  34.02 
 
 		 325 aa  53.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  23.35 
 
 		 720 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  23.35 
 
 		 720 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  21.89 
 
 		 740 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  23.35 
 
 		 720 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  23.39 
 
 		 746 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.35 
 
 		 726 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  23.35 
 
 		 720 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  23.35 
 
 		 726 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  23.35 
 
 		 720 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2132  chain length determinant protein  25.33 
 
 		 340 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  23.35 
 
 		 726 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  23.35 
 
 		 720 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0795  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.69 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.35 
 
 		 726 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.35 
 
 		 726 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.35 
 
 		 726 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  22.91 
 
 		 720 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  22.91 
 
 		 747 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  23.35 
 
 		 720 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.35 
 
 		 726 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1653  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.64 
 
 		 321 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0595159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.35 
 
 		 726 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  22.34 
 
 		 740 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  23.25 
 
 		 746 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0394  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  20.98 
 
 		 787 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  23.85 
 
 		 740 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  23.86 
 
 		 755 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0737  capsule polysaccharide export protein-like protein  25 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2975  chain length determinant family protein  32.29 
 
 		 317 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0085  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.98 
 
 		 787 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1087  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  20.98 
 
 		 787 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1245  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.98 
 
 		 787 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1525  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.98 
 
 		 787 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2840  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.98 
 
 		 787 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.540822  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2689  chain length determinant family protein  20.98 
 
 		 787 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0101  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.98 
 
 		 760 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2756  capsule polysaccharide export protein-like  25.13 
 
 		 400 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.415519  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  27.89 
 
 		 745 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  25.82 
 
 		 747 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4163  lipopolysaccharide biosynthesis  21.62 
 
 		 748 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.214287  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4203  lipopolysaccharide biosynthesis  21.62 
 
 		 748 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  20.7 
 
 		 720 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  22.92 
 
 		 727 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 		 735 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  27.37 
 
 		 745 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5579  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.906457 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  26.92 
 
 		 497 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  23.08 
 
 		 372 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2262  chain length determinant protein  24.9 
 
 		 327 aa  47.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0523506  decreased coverage  0.000488654 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  23.08 
 
 		 372 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>