65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0490 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00554  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  94.96 
 
 		 377 aa  738    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  98.94 
 
 		 377 aa  764    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0638  ferric enterobactin transport protein FepE  94.43 
 
 		 377 aa  734    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3057  ferric enterobactin transport protein FepE  94.16 
 
 		 377 aa  731    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  94.16 
 
 		 377 aa  734    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0490  ferric enterobactin transport protein FepE  100 
 
 		 377 aa  769    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0673  ferric enterobactin transport protein FepE  95.23 
 
 		 377 aa  739    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3039  lipopolysaccharide biosynthesis protein  94.43 
 
 		 377 aa  734    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.443281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00543  hypothetical protein  94.96 
 
 		 377 aa  738    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.589908  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0685  ferric enterobactin transport protein FepE  73.73 
 
 		 378 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0701  ferric enterobactin transport protein FepE  74.26 
 
 		 378 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0642  ferric enterobactin transport protein FepE  73.99 
 
 		 378 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.412553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0628  ferric enterobactin transport protein FepE  73.46 
 
 		 378 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0747  ferric enterobactin transport protein FepE  73.99 
 
 		 378 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3036  ferric enterobactin transport protein FepE  37.5 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.177075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1257  ferric enterobactin transport protein FepE  37.5 
 
 		 383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000394328  hitchhiker  0.0000000226828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3177  ferric enterobactin transport protein FepE  37.5 
 
 		 383 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1615  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 326 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.626955  normal  0.791839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1033  chain length determinant protein  26.32 
 
 		 326 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205095 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1630  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.38 
 
 		 326 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01929  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  26.02 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01915  hypothetical protein  26.02 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2639  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 		 332 aa  93.2  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1205  chain length determinant protein  25.36 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.747059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2960  chain length determinant protein  25.86 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000740001 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2318  chain length determinant protein  25.07 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0159  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  23.53 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2307  chain length determinant protein  28.17 
 
 		 327 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0598886 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4032  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  22.64 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.010328  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0183  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  22.64 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0513  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  22.64 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.283706 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2258  chain length determinant protein  26.27 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0308231 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2417  chain length determinant protein  26.84 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0117622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2305  chain length determinant protein  26.84 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0412425 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2204  chain length determinant protein  26.63 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0315  chain length determinant protein-like protein  22.78 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4009  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  22.03 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4201  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  22.92 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4149  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  20.85 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03612  hypothetical protein  21.75 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03663  Entobacterial Common Antigen (ECA) polysaccharide chain length modulation protein  21.75 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0114437  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5218  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  21.75 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.813852  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.75 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0658934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4296  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  21.75 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4002  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  21.75 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4136  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  21.75 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0162  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  21.68 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4218  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  21.75 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00115149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4145  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  21.17 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4248  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  21.17 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4307  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  21.17 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4130  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  21.17 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4199  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  20.89 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2841  lipopolysaccharide biosynthesis  21.69 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500509  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4001  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  21.05 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.641375  normal  0.0363623 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 324 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0278  O-antigen length determinant protein  36.21 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1674  lipopolysaccharide biosynthesis  24.4 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1384  lipopolysaccharide biosynthesis  22.95 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00868672 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0472  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.73 
 
 		 355 aa  46.2  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2541  lipopolysaccharide biosynthesis  22.63 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0795  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.09 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00688  hypothetical protein  27.37 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3033  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  normal  0.307874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>