61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2258 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2258  chain length determinant protein  100 
 
 		 327 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0308231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2305  chain length determinant protein  98.46 
 
 		 325 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0412425 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2307  chain length determinant protein  98.78 
 
 		 327 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0598886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2204  chain length determinant protein  98.78 
 
 		 327 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2417  chain length determinant protein  98.78 
 
 		 327 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0117622 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1205  chain length determinant protein  72.31 
 
 		 344 aa  486  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.747059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2960  chain length determinant protein  72.31 
 
 		 325 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000740001 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01929  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  72.39 
 
 		 327 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1033  chain length determinant protein  72.39 
 
 		 326 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205095 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2318  chain length determinant protein  71.38 
 
 		 344 aa  480  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01915  hypothetical protein  72.39 
 
 		 326 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1615  lipopolysaccharide biosynthesis protein  72.09 
 
 		 326 aa  474  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.626955  normal  0.791839 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1630  lipopolysaccharide biosynthesis protein  71.78 
 
 		 326 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2639  lipopolysaccharide biosynthesis protein  62.84 
 
 		 332 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5218  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  27.33 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.813852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4002  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  27.33 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.33 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0658934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03612  hypothetical protein  27.33 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4296  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  27.33 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4136  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  27.33 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03663  Entobacterial Common Antigen (ECA) polysaccharide chain length modulation protein  27.33 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0114437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4218  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  27.03 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00115149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4130  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  26.33 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4307  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  26.33 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4248  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  26.33 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4145  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  26.33 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4149  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  25.23 
 
 		 348 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4201  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  24.63 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4199  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  26.04 
 
 		 348 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4032  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  25.5 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.010328  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0183  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  25.28 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0628  ferric enterobactin transport protein FepE  27.14 
 
 		 378 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0642  ferric enterobactin transport protein FepE  27.14 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.412553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0701  ferric enterobactin transport protein FepE  26.86 
 
 		 378 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0685  ferric enterobactin transport protein FepE  27.14 
 
 		 378 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4009  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  24.34 
 
 		 348 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00554  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  28.57 
 
 		 377 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00543  hypothetical protein  28.57 
 
 		 377 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.589908  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  28.57 
 
 		 377 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0513  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  25.22 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.283706 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0638  ferric enterobactin transport protein FepE  28.37 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3039  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.37 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.443281  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0673  ferric enterobactin transport protein FepE  28.57 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3057  ferric enterobactin transport protein FepE  28.37 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  28.85 
 
 		 377 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0490  ferric enterobactin transport protein FepE  28.37 
 
 		 377 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4001  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  26.89 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.641375  normal  0.0363623 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0747  ferric enterobactin transport protein FepE  27.14 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0162  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  25.75 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0159  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  22.73 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3036  ferric enterobactin transport protein FepE  24.38 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.177075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1257  ferric enterobactin transport protein FepE  24.38 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000394328  hitchhiker  0.0000000226828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3177  ferric enterobactin transport protein FepE  24.38 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1969  O-antigen chain length regulator  22.93 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1674  lipopolysaccharide biosynthesis  23.05 
 
 		 364 aa  53.5  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0315  chain length determinant protein-like protein  28.02 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0419  chain length determinant protein  23.81 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.554474  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0795  lipopolysaccharide biosynthesis protein  46.51 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23360  O-antigen chain length regulator  21.85 
 
 		 360 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000253152  hitchhiker  0.00753817 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  20.88 
 
 		 365 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0278  O-antigen length determinant protein  40.91 
 
 		 325 aa  42.4  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>