44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0315 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0315  chain length determinant protein-like protein  100 
 
 		 347 aa  699    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3036  ferric enterobactin transport protein FepE  31.12 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.177075  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0628  ferric enterobactin transport protein FepE  23.47 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0701  ferric enterobactin transport protein FepE  24.55 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1257  ferric enterobactin transport protein FepE  30.61 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000394328  hitchhiker  0.0000000226828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3177  ferric enterobactin transport protein FepE  30.61 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0642  ferric enterobactin transport protein FepE  23.1 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.412553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0685  ferric enterobactin transport protein FepE  23.1 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3057  ferric enterobactin transport protein FepE  23.49 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00543  hypothetical protein  23.49 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.589908  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3039  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.443281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0638  ferric enterobactin transport protein FepE  23.49 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00554  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  23.49 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  23.13 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0673  ferric enterobactin transport protein FepE  23.13 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0490  ferric enterobactin transport protein FepE  22.78 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  22.42 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0747  ferric enterobactin transport protein FepE  24.91 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1033  chain length determinant protein  28.57 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205095 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01915  hypothetical protein  28.57 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01929  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  28.57 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1630  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203783  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2541  lipopolysaccharide biosynthesis  40.82 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3191  chain length determinant protein  42.86 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1384  lipopolysaccharide biosynthesis  52.5 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00868672 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2318  chain length determinant protein  28.5 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2960  chain length determinant protein  28 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000740001 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2669  lipopolysaccharide biosynthesis  40.43 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1205  chain length determinant protein  28 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.747059  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1397  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.74 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  40.82 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2841  lipopolysaccharide biosynthesis  41.3 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500509  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1615  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.626955  normal  0.791839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0795  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.55 
 
 		 315 aa  46.2  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  43.24 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.5 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2639  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1653  lipopolysaccharide biosynthesis protein  45.95 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0595159  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2090  chain length determinant family protein  44.44 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.77217  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2204  chain length determinant protein  28.29 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3789  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.59 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3033  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.11 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2258  chain length determinant protein  27.05 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0308231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4009  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  25.98 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>