60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2639 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2639  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
332 aa  674    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684026  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1205  chain length determinant protein  61.33 
 
 
344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.747059  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01929  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  61.14 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2318  chain length determinant protein  60.73 
 
 
344 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01915  hypothetical protein  61.14 
 
 
326 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1615  lipopolysaccharide biosynthesis protein  61.14 
 
 
326 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.626955  normal  0.791839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1033  chain length determinant protein  60.84 
 
 
326 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.205095 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2307  chain length determinant protein  62.54 
 
 
327 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0598886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2960  chain length determinant protein  60.12 
 
 
325 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000740001 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1630  lipopolysaccharide biosynthesis protein  60.54 
 
 
326 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203783  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2258  chain length determinant protein  62.84 
 
 
327 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0308231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2204  chain length determinant protein  62.84 
 
 
327 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2417  chain length determinant protein  62.24 
 
 
327 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0117622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2305  chain length determinant protein  62.69 
 
 
325 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0412425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5218  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  27.46 
 
 
348 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.813852  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.46 
 
 
348 aa  116  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0658934  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4136  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  27.46 
 
 
348 aa  116  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4002  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  27.46 
 
 
348 aa  116  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03612  hypothetical protein  27.46 
 
 
348 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4296  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  27.46 
 
 
348 aa  116  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03663  Entobacterial Common Antigen (ECA) polysaccharide chain length modulation protein  27.46 
 
 
348 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0114437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4218  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  27.46 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00115149  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4149  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  27.46 
 
 
348 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4145  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  25.6 
 
 
348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4130  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  25.9 
 
 
348 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4248  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  25.9 
 
 
348 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4307  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  25.9 
 
 
348 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4199  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  25.9 
 
 
348 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4001  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  26.02 
 
 
348 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.641375  normal  0.0363623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4201  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  24.32 
 
 
348 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0628  ferric enterobactin transport protein FepE  27.67 
 
 
378 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0642  ferric enterobactin transport protein FepE  27.4 
 
 
378 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.412553  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00543  hypothetical protein  27.01 
 
 
377 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.589908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00554  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  27.01 
 
 
377 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0701  ferric enterobactin transport protein FepE  27.45 
 
 
378 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0685  ferric enterobactin transport protein FepE  27.4 
 
 
378 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  26.72 
 
 
377 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  27.01 
 
 
377 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0638  ferric enterobactin transport protein FepE  26.72 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0673  ferric enterobactin transport protein FepE  27.01 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3039  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.443281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3057  ferric enterobactin transport protein FepE  26.72 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4009  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  22.66 
 
 
348 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0490  ferric enterobactin transport protein FepE  26.44 
 
 
377 aa  93.2  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0162  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  24.4 
 
 
350 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4032  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  26.01 
 
 
358 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.010328  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0183  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  26.01 
 
 
359 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0513  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  25.74 
 
 
339 aa  86.3  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.283706 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0747  ferric enterobactin transport protein FepE  27.72 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0159  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  21.58 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  23.2 
 
 
365 aa  65.9  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3036  ferric enterobactin transport protein FepE  22.03 
 
 
383 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.177075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1257  ferric enterobactin transport protein FepE  22.03 
 
 
383 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000394328  hitchhiker  0.0000000226828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3177  ferric enterobactin transport protein FepE  22.03 
 
 
383 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1674  lipopolysaccharide biosynthesis  21.27 
 
 
364 aa  53.1  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23360  O-antigen chain length regulator  22.99 
 
 
360 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000253152  hitchhiker  0.00753817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1969  O-antigen chain length regulator  21.41 
 
 
349 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2499  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.95 
 
 
522 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0315  chain length determinant protein-like protein  24.04 
 
 
347 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0278  O-antigen length determinant protein  42.22 
 
 
325 aa  42.7  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>