68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0472 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0472  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 355 aa  728    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4936  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 		 362 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0428435  normal  0.874346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4604  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.472389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.52 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.433116  normal  0.249189 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0889  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 		 415 aa  97.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0278  O-antigen length determinant protein  22.25 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2841  lipopolysaccharide biosynthesis  24.51 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500509  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2541  lipopolysaccharide biosynthesis  22.47 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3191  chain length determinant protein  23.03 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2902  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.08 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1653  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0595159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3033  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.19 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1384  lipopolysaccharide biosynthesis  22.1 
 
 		 324 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00868672 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00688  hypothetical protein  42.31 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0795  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.05 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2891  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2975  chain length determinant family protein  42.25 
 
 		 317 aa  57  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  23.43 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0764  lipopolysaccharide biosynthesis  34.88 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0283751  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 422 aa  52.8  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2132  chain length determinant protein  32.35 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  21.71 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1376  lipopolysaccharide biosynthesis  30.59 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648353  hitchhiker  0.00000667322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.03 
 
 		 730 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2090  chain length determinant family protein  35 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.77217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 507 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  30.59 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0419  chain length determinant protein  40.74 
 
 		 370 aa  49.7  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.554474  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.76 
 
 		 741 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  25 
 
 		 741 aa  49.3  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.74 
 
 		 741 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  25.74 
 
 		 741 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  25.74 
 
 		 741 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  26.76 
 
 		 741 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25 
 
 		 741 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.29 
 
 		 463 aa  47  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0490  ferric enterobactin transport protein FepE  36.73 
 
 		 377 aa  46.2  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  36.73 
 
 		 377 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0638  ferric enterobactin transport protein FepE  36.73 
 
 		 377 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3057  ferric enterobactin transport protein FepE  36.73 
 
 		 377 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3039  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.73 
 
 		 377 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.443281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00543  hypothetical protein  36.73 
 
 		 377 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.589908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00554  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  36.73 
 
 		 377 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1397  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.21 
 
 		 325 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  36.73 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0673  ferric enterobactin transport protein FepE  36.73 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2020  lipopolysaccharide biosynthesis  26.32 
 
 		 530 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2262  chain length determinant protein  20.62 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0523506  decreased coverage  0.000488654 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  35.29 
 
 		 726 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  25.52 
 
 		 740 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  35.29 
 
 		 726 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  35.29 
 
 		 726 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  35.29 
 
 		 726 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  35.29 
 
 		 726 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  35.29 
 
 		 726 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  20.16 
 
 		 409 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  35.29 
 
 		 726 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  35.29 
 
 		 726 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.56 
 
 		 720 aa  43.5  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  39.56 
 
 		 716 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3948  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.11 
 
 		 365 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1346  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 		 401 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2569  hypothetical protein  22.22 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028657  normal  0.698022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  21.27 
 
 		 708 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  28.57 
 
 		 732 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0162  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  31.75 
 
 		 350 aa  42.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>