34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0370 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0370  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 334 aa  681    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2902  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2841  lipopolysaccharide biosynthesis  19.13 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500509  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3191  chain length determinant protein  20.71 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2541  lipopolysaccharide biosynthesis  21.43 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1384  lipopolysaccharide biosynthesis  20.35 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00868672 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3033  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.35 
 
 		 320 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  20.75 
 
 		 328 aa  52.8  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0357  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1653  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.84 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0595159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  35.38 
 
 		 724 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  18.64 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2262  chain length determinant protein  23.34 
 
 		 327 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0523506  decreased coverage  0.000488654 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  32 
 
 		 720 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00688  hypothetical protein  20.24 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2669  lipopolysaccharide biosynthesis  28.57 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2655  lipopolysaccharide biosynthesis  34.02 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.147263  normal  0.015552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  36.17 
 
 		 724 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.79 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  48.72 
 
 		 784 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  33.33 
 
 		 723 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  37.93 
 
 		 747 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  32.26 
 
 		 720 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  32.26 
 
 		 720 aa  43.5  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  32.26 
 
 		 720 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  29.85 
 
 		 720 aa  43.5  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  32.26 
 
 		 720 aa  43.5  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  32.26 
 
 		 720 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  28.99 
 
 		 723 aa  43.5  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  32.26 
 
 		 720 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  32.26 
 
 		 720 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2891  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.56 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  41.18 
 
 		 751 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  46.81 
 
 		 784 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>